即將上線 · 2026 年 8 月正式開放
高雄醫學大學 疾病多體學研究中心

從多體學資料
到研究級分析成果

為臨床與精準醫療研究提供資料整合、生物資訊分析與成果視覺化服務,
協助研究者產出可追溯、可重現、適合投稿準備的分析結果。

依託高醫體系資料環境與研究中心分析流程,支援外部一般分析服務較難完成的院內臨床資料(EMR)、健保資料庫(KMUHRD)與 TPMI 基因型資料整合。

本平台由資訊運算組提供資料分析服務,不含樣本收集、檢體處理及實驗室分析。所有費用已含 21% 學校管理費。

您的研究需求,適合哪一類分析支援?

Who Is This For

從既有定序資料、院內資料串接,到投稿前圖表與方法整理,先快速判斷本平台能協助的情境。

已有定序或多體學資料,需要標準化分析

您已完成 WGS / WES / RNA-seq / microbiome 等定序,需要從原始資料到適合投稿準備的圖表與報告的完整分析流程。

需要串接 TPMI 或院內臨床資料

研究涉及 TPMI 基因型、電子病歷或健保資料庫,需要協助資料串接、清整與整合分析。

準備投稿或計畫申請,需要可重現圖表與報告

分析已有初步結果,但需要符合期刊標準的統計圖表、方法描述與可追溯的分析紀錄。

不確定資料是否足以分析,需要前期諮詢

尚在規劃階段,想先了解資料品質、樣本量是否足夠,以及分析方案的可行性。

四大分析服務

Four Core Analysis Services

定序與 RNA-seq 分析採 L1→L3 三級遞進,依分析深度選擇對應級別;金額為每樣本/每案/每小時之校內價(L3 客製化依小時計價)。

SEQUENCING

① 高通量定序分析

High-throughput Sequencing · WGS / WES / 癌症 panel
L1基礎流程:QC、比對、變異偵測每樣本 NT$3,000
L2進階:註釋、過濾、品質報告每樣本 NT$6,000
L3客製化深度分析與整合解讀每小時 NT$1,250
交付成果

QC 摘要報告、比對統計、變異清單(VCF)、功能註釋結果、過濾條件紀錄、分析流程文件與投稿用圖表。

RNA-SEQ

② RNA-seq 資料分析

Transcriptomics · bulk RNA-seq
L1bulk RNA-seq 標準分析每樣本 NT$3,000
L2差異分析、富集、視覺化每樣本 NT$6,000
L3進階客製化分析每小時 NT$1,250
目前開放 bulk RNA-seq 分析;蛋白質體、代謝體、scRNA-seq 與跨組學整合分析規劃中,開放時程另行公告。
交付成果

表現量矩陣、差異基因清單、富集分析結果(GO / KEGG / GSEA)、視覺化圖表(volcano、heatmap、PCA)與分析參數紀錄。

METAGENOMICS

③ Metagenomics 分析

Metagenomics · 微生物體
基本QC+多樣性分析每樣本 NT$1,000
客製進階/客製化分析每小時 NT$1,250
交付成果

OTU/ASV 表、alpha/beta diversity 分析、菌群組成圖、差異菌群統計(LEfSe)、疾病關聯分析結果與期刊投稿用圖表。

TPMI

④ TPMI 分析服務

Taiwan Precision Medicine Initiative · 基因型應用
SNPSNP 篩選(≥100 基因另行洽詢)每案 NT$2,500
變異全基因組變異頻率每案 NT$3,500
PRS多基因風險評分建構每案 NT$7,500
客製客製化分析每小時 NT$1,250
限高醫體系(校外不適用)。TPMI 資料由醫研部統計室管理,須經統計室協作;上列為本中心分析費,統計室另收資料處理與作業區費用(詳見下方協作流程)。
交付成果

基因型頻率統計、等位基因篩選結果、風險評分模型與預測效能報告、分析流程紀錄。

分析實績與能力展示

Portfolio & Capabilities

本中心分析團隊結合多體學分析、臨床資料整合與研究級資料庫建置經驗,以下為已完成或進行中的代表性工作。

TPMI 基因型資料分析成果圖
已執行

精準醫療與 TPMI 基因型資料分析

研究需求將基因型資料轉化為可解讀的疾病風險資訊
分析方法SNP 篩選、全基因組變異頻率、PRS 模型建構
產出成果風險評分模型、族群頻率統計、機器學習預測報告
Microbiome cladogram and 16S taxonomic composition analysis figure
研究實績

腸道微生物體與疾病關聯分析

研究需求探索腸道菌相與疾病之間的關聯
分析方法QIIME2/DADA2/LEfSe 完整 16S 與 metagenomics 流程
產出成果菌相組成圖、多樣性指標、差異菌群統計與投稿用圖表
TCGA-LIHC multi-omics analysis overview figure
已上線

癌症多體學資料整合與公開分析平台

研究需求大規模癌症世代資料需跨層次整合,並轉化為可公開查詢的線上資源
分析方法突變、CNV、甲基化與蛋白質體多層次資料整合、互動式視覺化與可重現分析流程
產出成果TCGA-LIHC 與 TCGA-BLCA 基因體入口網、跨世代 RNA-Seq 分析平台、跨癌別比較與互動式查詢介面
TCGA-LIHC Portal →TCGA-BLCA Portal →RNA-Seq 分析平台 →
WGS 分析流程與成果輸出示意圖
建置中

全基因組定序(WGS)分析流程

發展方向持續建置標準化 WGS 分析流程,支援變異偵測與基因功能註解
規劃能力定序資料處理、變異分析與基因功能註解整合

我們如何確保分析品質

Quality Assurance

使用標準化分析流程,每次執行保留完整版本與參數紀錄

每項分析包含品質控管(QC)檢查點,異常資料在進入下游前即被標記

重要結果可追溯至原始資料,支援審稿過程的方法查核與結果驗證

交付成果包含投稿用圖表與補充資料,可依投稿需求協助整理格式

客製化分析前提供可行性評估,確認資料量與品質足以支撐預期分析

院內資料依高醫體系資料治理與隱私保護規範處理

收費標準

Pricing · 校內 / 校外

費用以新台幣計、已含 21% 學校管理費,不涉及研資組管理之儀器設備。

服務項目內容校內校外
① 高通量定序分析(WGS / WES / 癌症 panel)
L1 / L2 分析基礎~進階每樣本 NT$3,000–6,000每樣本 NT$3,600–7,200
L3 客製化深度分析客製化深度分析與整合解讀每小時 NT$1,250每小時 NT$1,500
② RNA-seq 資料分析(bulk RNA-seq)
L1 / L2 分析bulk RNA-seq 基礎~進階每樣本 NT$3,000–6,000每樣本 NT$3,600–7,200
L3 進階客製化分析依研究需求客製化計價每小時 NT$1,250每小時 NT$1,500
③ Metagenomics 分析
基本分析QC+多樣性每樣本 NT$1,000每樣本 NT$1,200
客製化分析進階微生物群分析每小時 NT$1,250每小時 NT$1,500
④ TPMI 分析服務(限高醫體系,校外不適用)
SNP 篩選≥100 基因另行洽詢每案 NT$2,500不適用
全基因組變異頻率變異頻率與統計分析每案 NT$3,500不適用
PRS 建構多基因風險評分建構每案 NT$7,500不適用
客製化分析進階基因關聯與風險分析每小時 NT$1,250不適用
最小樣本數量為 50 個樣本,大於 100 個樣本享 85 折;200 個樣本以上另行洽詢。
TPMI 分析服務:本服務限高醫體系(校外不適用)。TPMI 資料由醫研部統計室管理,須經統計室協作。上表為本中心分析費用;統計室另收資料檢索整理費、獨立作業區設備使用費及資料清整費,實際金額請於申請前向統計室確認(詳見下方「TPMI 協作流程」)。
需要估價或申請? 線上填寫繳費單,勾選項目、輸入數量即自動試算費用,可直接列印或存成 PDF;亦可下載空白表單手填。
線上填寫繳費單 / 試算費用 →

為什麼選擇本平台

Why Us

院內資料協作經驗

具備 TPMI 基因型、EMR 與 KMUHRD 等院內資料的協作經驗,熟悉跨單位資料整合的實務流程。

研究型分析交付

交付成果不只是數據,而是包含統計圖表、方法描述與分析紀錄,可直接用於投稿準備與計畫申請。

可重現流程與版本紀錄

每次分析保留完整參數與執行紀錄,結果可追溯至原始資料,支援審稿查核與後續延伸。

從諮詢到成果整理的一站式支援

從前期可行性評估、資料處理、統計分析到圖表整理,單一窗口完成,不必在多家廠商間協調。

申請流程

How It Works

一般分析服務・申請流程

適用高通量定序、RNA-seq 資料分析、Metagenomics等非 TPMI 服務。單一窗口、四步完成:

① 諮詢
  • 以 email 或當面聯繫本中心
  • 說明研究目標、資料類型與樣本數
  • 初步確認分析可行性
② 評估與報價
  • 確認分析級別(L1 / L2 / L3)
  • 評估資料品質與前處理需求
  • 提供正式報價與時程預估
③ 繳費與執行
  • 填寫繳費單、完成校內繳費程序
  • 提供原始資料(或由本中心取得)
  • 依約定方案執行分析
④ 交付與確認
  • 交付分析結果、圖表與流程紀錄
  • 說明結果解讀重點
  • 依需求協助投稿圖表整理

※ 客製化分析(L3 / 計時)在正式執行前會先提供可行性評估,確認資料與方案後才啟動計時。每案資訊異動以 3 次為限。

TPMI 分析服務・協作流程

TPMI 資料由醫研部統計室(醫學統計分析及生物資訊研究室)管理,須經統計室協作進行。流程分兩段、費用亦分兩部分:

① 統計室
  • 受理線上申請
  • 病歷資料串連與清整
  • 提供 TPMI 獨立作業區
收費:資料檢索整理費、獨立作業區設備使用費、資料清整費(金額依統計室確認)
② 本中心
  • 於獨立作業區進行基因體分析
  • SNP 篩選/變異頻率/PRS/客製化
收費:分析費用(如上表 TPMI 項目)
③ 釋出
  • 經 TPMI 資料安全委員會複審
  • 分析結果釋出給申請者

※ TPMI 申請者需同時與統計室及本中心協作;統計室之資料檢索整理費、獨立作業區設備使用費及資料清整費請於申請前向統計室確認,本中心分析費用可於線上繳費單試算。

服務條款與注意事項

  • 所有費用以新台幣計,已含 21% 學校管理費,不涉及研資組管理之儀器設備。
  • 本平台僅提供資料分析,不含樣本收集、檢體處理及實驗室分析(請洽臨床世代組或多體學技術組)。
  • 單案金額達 NT$100,000 以上者需簽訂服務合約;達政府採購法門檻者依相關規定辦理。
  • 每案資訊異動以 3 次為限。
  • TPMI 申請需提供:KMUHRD 申請年度、疾病代碼(ICD-9+ICD-10)、健保用藥代碼(選填)、納入/排除條件、基因名稱(限 SNP 篩選案)。

即將於 2026 年 8 月正式開放

歡迎校內外研究人員預先諮詢分析需求

平台主負責人:王照元 教授 · 疾病多體學研究中心 資訊運算組